1988年5月9日，国务院发布《关于公布第二批国家级森林和野生动物类型自然保护区的通知》，将祁连山自然保护区列为国家级森林和野生动物类型自然保护区。
即位于上山坑，且有一定树龄的红豆杉树。
意思：“一个金色的峡谷”。
保护小区位于松源街道班岱后村，以保护区所在的村庄及保护树种得名。
在保护区内生存有100多种动物，其中有世界独有的动物珍品——白头叶猴18群240多只，为保护此动物，建设为国家级自然保护区。
以郭洞村命名次生林自然保护小区。
因是专门为保护枫树坝水库区域的生态系统为主，纵贯整个自然保护区，故名。
为了更好保护华南虎的栖息地，故名。
具有代表性的自然生态系统、珍稀濒危野生动植物的天然集中分布，有特殊意义的自然遗迹等保护对象所在的陆地，依法划出一定面积予以特殊保护和管理的区域。
因公园地处丰溪，性质为自然保护区，故名丰溪自然保护区。
因该遗址位于石马村，故而得名。
何坑，自然村名；何坑自然保护小区，即位于何坑自然村，国家为了保护珍贵和濒危动、植物以及各种典型的生态系统，保护珍贵的地质剖面，为进行自然保护教育、科研和宣传活动提供场所，并在指定的区域内开展旅游和生产活动而划定的特殊区域。
发现亚洲最大晰脚类恐龙化石而得名。
因该保护区分布在小流坑和青嶂山两个地区，且是保护野生动物为主要职能，故名。
因位于垅前山，主要种植油杉林，故名。
1983年，甘肃省人民政府批准成立了甘肃省莲花山自然保护区管理局，于2003年6月晋升为国家级自然保护区。
因位于峡口镇新田村石峡沟内而得名石峡沟浆鳞鱼化石区。
因山体形态为石块顺沟谷带状分布，故名。
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